В 2010 г. с целью научного сопровождения государственной деятельности по управлению рыболовством, координации выполнения планов и программ рыбохозяйственных научно-исследовательских работ всех рыбохозяйственных направлений научных организаций на территории Республики Саха (Якутия), в г. Якутск был создан Якутский филиал ФГБНУ «Госрыбцентр».
На основании приказа Росрыболовства от 10 августа 2018 г. №537, Якутский филиал ФГБНУ «Госрыбцентр» был присоединен в качестве филиала к федеральному государственному бюджетному научному учреждению «Всероссийский научно-исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии» («ЯкутскНИРО»).
Якутский филиал ФГБНУ «ВНИРО» проводит научные экспедиционные исследования и разрабатывает материалы, обосновывающие общие допустимые уловы (ОДУ) и рекомендованные объемы вылова (РВ) водных биоресурсов водных объектов Республики Саха (Якутия). Научные исследования филиала охватывают вопросы государственного мониторинга, рационального использования, изучения, сохранения, воспроизводства водных биоресурсов, среды их обитания и аквакультуры.
Полномочия «ЯкутскНИРО» определены Положением о Якутском филиале (Положение о Якутском филиале федерального государственного бюджетного научного учреждения «Всероссийский научно-исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии» от 3.12.2018 г.).